OSS-register: Overzicht

Dutch-NIC-EMC-RIVM

Supplementary Information for the article "A Model of Individual BMI Trajectories" by Laurens Bogaardt, Anoukh van Giessen, H. Susan J. Picavet, Hendriek C. Boshuizen published on 26 February 2024 in Mathematical Medicine and Biology.

SimpleBox (4nano)

Effectiveness of a COVID-19 contact tracing app in a simulation model with indirect and informal contact tracing

| | |------------------------------------------------------------------------| | BELANGRIJK: Deze repository bevat synthetische data, met een andere licentie dan de code (CC BY-NC-ND, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/?). Deze synthetische data zijn gemaakt met datasets met individuele persoonsgegevens, waar de echte personen zijn vervangen door 'neppersonen'. Dat is gedaan op zo'n manier dat analyse van de synthetische data ongeveer dezelfde resultaten geeft als analyse van de oorspronkelijke data. Als echte personen zich toch lijken te herkennen in de synthetische data, dan is dat zuiver toeval: wij publiceren geen persoonsgegevens. Statistische eigenschappen van de synthetische data anders dan de resultaten in deze repository zijn niet noodzakelijkerwijs gelijk aan statistische eigenschappen van de oorspronkelijke data. Deze synthetische data mogen niet buiten deze repository gebruikt worden. | | IMPORTANT: This repository contains synthetic data, with a different license from the code (CC BY-NC-ND, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/?). These synthetic data have been created from datasets with personal information, but with real persons replaced by 'fake persons'. That has been done in such a way that the analysis of the synthetic data gives approximately the same results as analysis of the original data. If real persons seem to recognise themselves in the synthetic data, then that is pure coincidence: we do not publish personal data. Statistical properties of the synthetic data other than the results in this repository do not necessarily reflect the statistical properties of the original data. These synthetic data may not be used outside this repository. |

Quick estimation of Candida auris clade using mash

Scripts used for the paper Inferring Hospital Admissions from SARS-CoV-2 Virus Loads in Wastewater in the Netherlands, August 2020 – February 2022

SARS-CoV-2_sewage

Annotation of chromosomes and plasmids of bacteria (AMR group)

Re-formatting Fasta headers to fit CLC bio. Requested by the AMR group.

Creating and uploading containers to ghcr